1. לאחר שימוש בצמר גפן סטרילי, סגור מחדש את האריזה החיצונית. לאחר הפתיחה, הספוגיות נשארות סטריליות עד 24 שעות אם מאוחסנות כראוי; מעבר לתקופה זו, הם אינם סטריליים יותר עקב זיהום על ידי חיידקים הנישאים באוויר ומיקרואורגניזמים אחרים.
2. חיטוי רק הורג מיקרואורגניזמים פתוגניים, ואילו עיקור מבטל אפילו נבגי חיידקים. אם ספוגיות צמר גפן מזוהמות בנבגי חיידקים, חומרי החיטוי אינם יעילים נגדם-וחומר החיטוי עצמו עלול אפילו להזדהם. שימוש בספוגיות לא-כאלה על פצע אינו מספק חיטוי ועלול במקום זאת לעורר זיהום; לכן, לעולם אל תשתמש במקלות צמר גפן שאינן עוד סטריליות על פצעים.
3. אין להחדיר צמר גפן לתוך תעלת האוזן. ניסיון להסיר שעוות אוזניים עם ספוגית עלול לעקור את השעווה ולגרום לה להתקבץ, לדחוף אותה עמוק יותר לתוך התעלה וליצור חסימה. זה יכול להוביל לכאב, בעיות שמיעה, טינטון או סחרחורת, שעלולים לדרוש טיפול רפואי. יתר על כן, החדרת ספוגית עמוק מדי מסכנת את קריעת עור התוף.
